Borneo FC Samarinda yang dimiliki oleh Nabil Husien Said Amin ini didirikan pada 7 Maret 2014. Berbasis di Samarinda, klub ini berjuluk Pesut Etam.

Borneo FC Samarinda yang sebelumnya bernama Pusamania Borneo FC ini dalam sejarahnya sudah mengoleksi gelar Divisi Utama di tahun 2014, gelar ini terasa spesial karena didapat  dalam kurun waktu kurang dari satu tahun usia berdirinya Borneo FC Samarinda.